| 序号 | 机构名称 | 所属单位 | 机构负责人 | 发文时间 |
| 1 | 南京邮电大学智能系统应用技术研究院 | 自动化学院 | 陈璐 | 2021.3.23，2024年4月3日变更院长及成员 |
| 2 | 南京邮电大学医疗信息应用技术研究所 | 通信与信息工程学院 | 郭永安 | 2021.3.23 |
| 3 | 南京邮电大学图像与机器智能处理应用技术研究所 | 通信与信息工程学院 | 谢世朋 | 2021.3.23 |
| 4 | 南京邮电大学集成电路应用技术研究院 | 集成电路科学与工程学院 | 蔡志匡 | 2021.3.23；2021.12.16 |
| 5 | 南京邮电大学柔性智能应用技术研究所 | 通信与信息工程学院 | 成孝刚 | 2021.12.16 |
| 6 | 南京邮电大学地球物理勘探通信应用技术研究所 | 电子与光学工程学院、柔性电子（未来技术）学院 | 郝学元 | 2021.12.16 |
| 7 | 南京邮电大学先进网络与智能工业软件应用技术研究院 | 计算机学院、软件学院、网络空间安全学院 | 王磊 | 2021.12.16； 2024.12.122021.12.16； 2024.12.12 |
| 8 | 南京邮电大学多源融合感知系统应用技术研究所 | 自动化学院 | 高浩 | 2021.12.16 |
| 9 | 南京邮电大学智能光网络应用技术研究所 | 电子与光学工程学院、柔性电子（未来技术）学院 | 涂兴华 | 2022.7.11 |
| 10 | 南京邮电大学激光装备应用技术研究所 | 电子与光学工程学院、柔性电子（未来技术）学院 | 沈建平 | 2022.7.11 2025.5.202022.7.11 2025.5.20 |
| 11 | 南京邮电大学海洋卫星通信应用技术研究所 | 电子与光学工程学院、柔性电子（未来技术）学院 | 程勇 | 2022.7.11 |
| 12 | 南京邮电大学数据安全合规应用技术研究所 | 计算机学院、软件学院、网络空间安全学院 | 孙国梓 | 2022.7.11 |
| 13 | 南京邮电大学空天群智通信应用技术研究院 | 通信与信息工程学院 | 史焱 | 2023.4.20 |
| 14 | 南京邮电大学智慧物联网应用技术研究院 | 物联网学院 | 张登银 | 2023.4.20 |
| 15 | 南京邮电大学信息感知与智能处理应用技术研究院 | 电子与光学工程学院、柔性电子（未来技术）学院 | 孙科学 | 2024.5.20 2025.11.4 |
| 16 | 南京邮电大学系统安全与可靠性工程应用技术研究所 | 现代邮政学院 | 周倩 | 2024.5.20 |
| 17 | 南京邮电大学密码工程应用技术研究所 | 计算机学院、软件学院、网络空间安全学院 | 董建阔 | 2024.12.12 |
| 18 | 南京邮电大学光谱成像感知与应用技术研究所 | 计算机学院、软件学院、网络空间安全学院 | 郑志忠 | 2024.12.12 |
| 19 | 南京邮电大学国土空间智能感知应用技术研究所 | 物联网学院 | 周鑫鑫 | 2025.11.4 |
| 20 | 南京邮电大学空地协同无人物流应用技术研究所 | 现代邮政学院 | 张学军 | 2025.11.4 |
